More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0163 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 331 aa  674    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  69.69 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  67.19 
 
 		 329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  63.12 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  63.52 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  59.87 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  63.04 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  58.62 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  58.95 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  60.49 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  57.93 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  59.87 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  60.69 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  59.25 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  60.37 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  53.55 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  57.58 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  57.32 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  57.63 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  59.04 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  58.13 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  59.34 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  61.37 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  57.05 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  58.54 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  56.88 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  60 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  56.02 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  58.15 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 337 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  56.71 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  56.7 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  61.06 
 
 		 329 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  55.8 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  56.53 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  55.17 
 
 		 327 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  55.8 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  56.11 
 
 		 327 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  58.2 
 
 		 344 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  57.89 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 328 aa  349  5e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  57.75 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  58.36 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  54.23 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  55.93 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.19 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  51.45 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  48.6 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  52.09 
 
 		 328 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  46.95 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.68 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.95 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  48.12 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  46.84 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  44.86 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 332 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 		 328 aa  299  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.08 
 
 		 331 aa  297  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  47.26 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  48.59 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>