More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1711 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
329 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  67.19 
 
 
331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  62.61 
 
 
350 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  59.75 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  59.25 
 
 
353 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  61.66 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  61.11 
 
 
327 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  60.62 
 
 
329 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  58.44 
 
 
328 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  59.5 
 
 
326 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 
332 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  58.1 
 
 
330 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  61.76 
 
 
330 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  58.81 
 
 
331 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 
338 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  55.35 
 
 
330 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  60.31 
 
 
335 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  57.05 
 
 
337 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  56.7 
 
 
330 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  58.18 
 
 
328 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  56 
 
 
341 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 
328 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  53.37 
 
 
341 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  56.7 
 
 
330 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  57.41 
 
 
322 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  55.52 
 
 
329 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  55.35 
 
 
330 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  55.17 
 
 
327 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 
328 aa  358  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  55.18 
 
 
330 aa  358  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 
329 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  55.17 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  56.07 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
328 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
336 aa  354  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 
330 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  53.33 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  52.58 
 
 
337 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  54.23 
 
 
326 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  54.04 
 
 
333 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  52.13 
 
 
328 aa  346  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  53.92 
 
 
332 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  55 
 
 
339 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 
327 aa  341  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
337 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
328 aa  338  7e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 
329 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 
337 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 
344 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 
344 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 
323 aa  323  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.41 
 
 
320 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 
332 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.94 
 
 
333 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.72 
 
 
327 aa  322  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 
326 aa  322  7e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  48.63 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  52.34 
 
 
338 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  48.63 
 
 
332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
323 aa  317  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  51.52 
 
 
350 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 
321 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 
332 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  51.37 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  49.05 
 
 
354 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
324 aa  308  8e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 
334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  45.77 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  45.87 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 
324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  46.52 
 
 
327 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 
332 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 
337 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.42 
 
 
330 aa  301  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 
332 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  49.21 
 
 
328 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 
328 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 
324 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 
332 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 
328 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 
328 aa  295  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 
328 aa  295  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  46.81 
 
 
329 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 
330 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 
330 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 
330 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  48.42 
 
 
327 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.52 
 
 
330 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>