More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1332 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  87.27 
 
 		 330 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  87.58 
 
 		 330 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  62.19 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  60.37 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  61.68 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  60.37 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  59.69 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  61.11 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  59.31 
 
 		 329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  54.26 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  57.94 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  53 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.69 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  54.06 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  55.31 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  52.66 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  55.21 
 
 		 331 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 323 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.06 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  52.81 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.68 
 
 		 329 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  52.85 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  52.68 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  52.85 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  52.85 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  49.68 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.47 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.01 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.17 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.42 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  43.99 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.58 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.52 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  46.52 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.86 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.48 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  44.3 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  47.8 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.91 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  49.52 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  48.26 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 336 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 329 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  51.58 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  47 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>