More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0016 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 327 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  75 
 
 		 332 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  67.18 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  66.87 
 
 		 328 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  67.08 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  54.01 
 
 		 332 aa  360  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  54.09 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.32 
 
 		 332 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 324 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 323 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.31 
 
 		 332 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.54 
 
 		 333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 332 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 330 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.97 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.38 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 326 aa  319  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.21 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.21 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.3 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.61 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 328 aa  308  9e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  48.72 
 
 		 356 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 329 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  45.17 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 320 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.87 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  48.44 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  47.19 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  46.39 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  47.2 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  46.96 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.27 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 329 aa  291  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.94 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  42.81 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  44.59 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  43.57 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  44.07 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  46.37 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  48.12 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  48.25 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 351 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.23 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 319 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.77 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>