More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4416 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
328 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  77.37 
 
 
328 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  77.37 
 
 
328 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  67.89 
 
 
328 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  67.07 
 
 
328 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  62.62 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  61.49 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  62.19 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  62.62 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  60.87 
 
 
327 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 
324 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  53.92 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  52.98 
 
 
329 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  52.37 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  51.44 
 
 
337 aa  325  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.57 
 
 
327 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 
329 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.37 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  48.42 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 
324 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
327 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  52.53 
 
 
349 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
327 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  50.79 
 
 
330 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 
348 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 
332 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.62 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.62 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  48.89 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 
332 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 
332 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  46.91 
 
 
333 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 
330 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 
328 aa  299  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  49.21 
 
 
337 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 
328 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.74 
 
 
326 aa  295  1e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
330 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 
332 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 
327 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.95 
 
 
330 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 
328 aa  292  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  47.47 
 
 
354 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.18 
 
 
327 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 
329 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 
326 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 
332 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 
328 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 
337 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 
329 aa  289  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 
337 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.77 
 
 
329 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  47.65 
 
 
332 aa  287  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  44.97 
 
 
330 aa  285  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.23 
 
 
331 aa  285  8e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  44.59 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  45.28 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.43 
 
 
326 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 
324 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 
322 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 
332 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.35 
 
 
320 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 
330 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 
323 aa  275  7e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 
329 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
330 aa  272  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  47.24 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
330 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 
328 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
328 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 
330 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 
328 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 
334 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  43.53 
 
 
334 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 
330 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
331 aa  268  8e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 
330 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  43.31 
 
 
330 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
330 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
330 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  49.2 
 
 
339 aa  265  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  47 
 
 
333 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  47.3 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  43.63 
 
 
330 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  47.3 
 
 
321 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>