More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1555 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  63.94 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  63.03 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  61.52 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  61.14 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  58.61 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  61.82 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  57.49 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  52.45 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  52.45 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  52.45 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  52.45 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  52.15 
 
 		 330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  52.45 
 
 		 330 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 		 330 aa  359  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 330 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 		 330 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 328 aa  358  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  51.83 
 
 		 354 aa  352  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.66 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  51.21 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.94 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 332 aa  339  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  51.53 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  50.94 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 329 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  47.71 
 
 		 328 aa  318  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  45.92 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  47.29 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  47.67 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  44.11 
 
 		 329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.65 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  43.73 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.98 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  45.31 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  44.55 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.26 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.74 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.46 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.32 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 329 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  47.94 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.01 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  44.05 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  45.62 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  45.7 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  43.79 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  42.68 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  45 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  45.56 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>