More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1088 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
329 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  71.95 
 
 
328 aa  498  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  71.95 
 
 
328 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  69.33 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  67.08 
 
 
327 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  66.26 
 
 
328 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  66.26 
 
 
328 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  66.56 
 
 
328 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  64.13 
 
 
330 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  61.47 
 
 
330 aa  418  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 
331 aa  408  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
330 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
330 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  59.02 
 
 
331 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  60.37 
 
 
330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  59.45 
 
 
328 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 
330 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  61.09 
 
 
333 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  58.1 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  61.11 
 
 
324 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  57.49 
 
 
334 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  58.62 
 
 
328 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  57.41 
 
 
329 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  56.88 
 
 
332 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  57.59 
 
 
332 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  56.52 
 
 
332 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  55.9 
 
 
332 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  56.35 
 
 
329 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 
337 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  54.88 
 
 
328 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 
337 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  56.88 
 
 
326 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  53.64 
 
 
329 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  53.19 
 
 
326 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  54.97 
 
 
333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  53.66 
 
 
330 aa  361  7.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  53.66 
 
 
330 aa  361  7.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 
327 aa  359  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  54.37 
 
 
323 aa  358  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 
326 aa  355  5e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 
321 aa  351  8e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  54.71 
 
 
331 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  52.96 
 
 
332 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 
325 aa  345  6e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  56.11 
 
 
332 aa  345  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 
328 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  53.44 
 
 
327 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  52.81 
 
 
324 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 
330 aa  342  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
327 aa  342  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
332 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  55.66 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  56.47 
 
 
316 aa  339  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  52.52 
 
 
331 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
351 aa  338  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  51.38 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  55.84 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  54.37 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 
329 aa  335  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 
318 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 
326 aa  333  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  53.63 
 
 
327 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  53.48 
 
 
320 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
320 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  48 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 
329 aa  318  6e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 
356 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 
324 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.93 
 
 
327 aa  315  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
327 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
327 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  53.58 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 
334 aa  311  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  48.08 
 
 
336 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  47.79 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  48.61 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.8 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  48.52 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  48.22 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
328 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  50.3 
 
 
329 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 
328 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.26 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  48.22 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  48.22 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>