More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2693 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 327 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  59.45 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  57.98 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  58.54 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  51.56 
 
 		 328 aa  342  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.89 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 		 328 aa  340  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  48.02 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 330 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.42 
 
 		 334 aa  328  7e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 330 aa  318  9e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.16 
 
 		 330 aa  318  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  46.5 
 
 		 331 aa  316  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  45.59 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  45.59 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 329 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.32 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.57 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.79 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  43.73 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  43.73 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 332 aa  299  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 332 aa  298  9e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 331 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.77 
 
 		 332 aa  296  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.99 
 
 		 334 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  50.32 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  47.32 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  49.06 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  48 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  43.94 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  48.12 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.11 
 
 		 337 aa  281  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.72 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  42.33 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  48.58 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  42.2 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  45.86 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  46.01 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  43.77 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  46.39 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  46.4 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 		 329 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  47.34 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  43.73 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  44.85 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 324 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  46.81 
 
 		 332 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>