More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2726 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 324 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  96.24 
 
 		 321 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  95.3 
 
 		 321 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  80.25 
 
 		 320 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  62.89 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  58.31 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  56.43 
 
 		 333 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  57.19 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  54.55 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  55.17 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  55.49 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  55.17 
 
 		 337 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  59.49 
 
 		 332 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 326 aa  351  8.999999999999999e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  53.77 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 		 326 aa  348  6e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50.94 
 
 		 333 aa  341  9e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 		 328 aa  341  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.44 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  54.4 
 
 		 324 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  51.54 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  54.23 
 
 		 329 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  53.48 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 330 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.77 
 
 		 332 aa  322  7e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 		 330 aa  321  9.000000000000001e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.37 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 329 aa  318  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  52.83 
 
 		 329 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  51.98 
 
 		 329 aa  310  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  53 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  52.17 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.55 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  51.75 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50.73 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 332 aa  302  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  50.64 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  44.89 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  48.9 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  48.25 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.09 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  50.64 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  48.91 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  49.37 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  52.81 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  44.44 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  48.88 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.13 
 
 		 327 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  46.87 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  48.73 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>