More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1950 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 328 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  60.31 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  60.31 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  59.45 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  56.57 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  54.91 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  55.32 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.66 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  52.76 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  53.05 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  52.91 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 		 333 aa  360  3e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  53.52 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  55.14 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.8 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 332 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 332 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 321 aa  328  8e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  50.78 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  53.27 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.48 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.63 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  46.32 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  45.87 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  48.33 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 331 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  52.42 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.32 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  50.62 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  48.14 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  49.42 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 		 324 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 327 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 320 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  45.97 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  44.98 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  43.92 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 350 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>