More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1463 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 320 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  73.67 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  69.87 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  69.4 
 
 		 327 aa  434  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  66.98 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  65.4 
 
 		 316 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  67.09 
 
 		 321 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  63.44 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  61.56 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  61.13 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  60.83 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  58.31 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 328 aa  349  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 328 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  60.38 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  60.38 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 330 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  56.33 
 
 		 322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  54.09 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  54.23 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  56.25 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 327 aa  315  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.96 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.48 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.48 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  308  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 		 323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  51.42 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.04 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 329 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 328 aa  301  9e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 334 aa  300  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  48.9 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 		 337 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 		 332 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 331 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 337 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.06 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  43.71 
 
 		 328 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  44.48 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.45 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.6 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.5 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.6 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.28 
 
 		 333 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  45.54 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  48.73 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  47.77 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  48.73 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  43.79 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  43.79 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>