More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 321 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  73.67 
 
 		 320 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  71.38 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  69.78 
 
 		 327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  68.59 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  69.3 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  68.04 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  62.58 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  60.99 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  60.88 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  58.62 
 
 		 328 aa  361  9e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  59.42 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.94 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  59.37 
 
 		 322 aa  340  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  57.63 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  58.9 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  52.05 
 
 		 354 aa  322  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 330 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  51.4 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.58 
 
 		 329 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 326 aa  318  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  53.61 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 327 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 337 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.23 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 331 aa  301  9e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 332 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.28 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.56 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  46.75 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.41 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  48.28 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  49.08 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  48.59 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  45.6 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 324 aa  281  7.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  46.04 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.28 
 
 		 333 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.37 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  47.08 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  43.48 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>