More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4242 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 332 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  76.2 
 
 		 332 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  75.9 
 
 		 332 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  73.72 
 
 		 333 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  71.87 
 
 		 332 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  71.87 
 
 		 332 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  73.15 
 
 		 329 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  67.17 
 
 		 337 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  66.87 
 
 		 337 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  66.15 
 
 		 332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  61.92 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  62.42 
 
 		 324 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  61.18 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  59.44 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  57.72 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  55.13 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  59.38 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  55.9 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  57.28 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  56.17 
 
 		 324 aa  371  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  57.1 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  56.52 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  56.48 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  56.17 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  57.28 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  56.44 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 328 aa  364  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 328 aa  364  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  57.59 
 
 		 329 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  56.43 
 
 		 329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  54.66 
 
 		 331 aa  360  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  58.49 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  56.31 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 328 aa  358  5e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  53.87 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  58.18 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  54.32 
 
 		 327 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  54.52 
 
 		 328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  53.27 
 
 		 328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 330 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  52.94 
 
 		 330 aa  354  8.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  54.46 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  53.37 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  53.23 
 
 		 332 aa  345  4e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 332 aa  345  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 		 330 aa  345  7e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 		 330 aa  345  7e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  54.13 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  54.69 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  53.23 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  51.69 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  52.78 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  54.69 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  54.37 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  52.34 
 
 		 327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  53.92 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 		 328 aa  328  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  52.22 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  52.22 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  54.01 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  48.6 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  49.43 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>