More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1769 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 320 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  76.71 
 
 		 322 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  62.86 
 
 		 316 aa  384  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  63.14 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  60.83 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  59.06 
 
 		 323 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  57.73 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  60.19 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 319 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  57.51 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  59.74 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  57.91 
 
 		 321 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  59.42 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 327 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.92 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  47.62 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  46.98 
 
 		 328 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.21 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  44.94 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  48.6 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  41.93 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  44.86 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.17 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  44.72 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  42.09 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  43.08 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  45.45 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  43.57 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  45.16 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  43.08 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  43.22 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  45.6 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  44.03 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  43.99 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  45.99 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.57 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  44.97 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  46.46 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 332 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  41.01 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  42.27 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  41.8 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  46.03 
 
 		 327 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  45.2 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  40.69 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  47.49 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  47.49 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  44.16 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  42.63 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.37 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  40.88 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  40.94 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  45.75 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  42.11 
 
 		 333 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>