More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3871 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 320 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  62.97 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  62.19 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  56.39 
 
 		 336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  54.97 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  56.88 
 
 		 332 aa  344  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  52.52 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  49.36 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  47.53 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 319 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  48.08 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1198  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  48.72 
 
 		 329 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  48.72 
 
 		 329 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 326 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  51.39 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  43.44 
 
 		 326 aa  260  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  44.62 
 
 		 328 aa  255  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  42.55 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  44.38 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  42.01 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  42.81 
 
 		 333 aa  251  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.96 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  44.92 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  43.38 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.15 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 332 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  44.62 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  39.62 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.96 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  44.79 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.81 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  41.05 
 
 		 327 aa  242  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  38.79 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  38.67 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  41.82 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  45.34 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  41.74 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 329 aa  238  6.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  40.56 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  39.39 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  46.88 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>