More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0284 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  679    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  91.82 
 
 		 334 aa  630  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  72.73 
 
 		 331 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  67.27 
 
 		 333 aa  455  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  66.16 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  63.03 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  63.03 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  62.12 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  61.47 
 
 		 328 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  61.47 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  61.16 
 
 		 328 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  61.04 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  58.1 
 
 		 326 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  56.84 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  58.1 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  54.85 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  56.13 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 332 aa  354  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 332 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  51.08 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.28 
 
 		 328 aa  342  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.55 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  51.38 
 
 		 332 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  52.13 
 
 		 326 aa  338  8e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 324 aa  335  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 329 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 323 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  51.41 
 
 		 324 aa  325  9e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 331 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 324 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 332 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  49.08 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  47.42 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  45.59 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.61 
 
 		 337 aa  310  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.69 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  43.57 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.19 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 327 aa  295  6e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  43.29 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.12 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  43.56 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  45.22 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  45.66 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  47.17 
 
 		 316 aa  291  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>