More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4181 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  98.8 
 
 
332 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
332 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  71.87 
 
 
332 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  72.48 
 
 
332 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  72.87 
 
 
333 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  71.65 
 
 
332 aa  502  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  68.92 
 
 
329 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  64.33 
 
 
337 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  64.44 
 
 
337 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  64.71 
 
 
332 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  58.15 
 
 
326 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  56.52 
 
 
321 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  58.07 
 
 
324 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  55.9 
 
 
323 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 
328 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  55.31 
 
 
354 aa  362  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  54.8 
 
 
325 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 
326 aa  362  6e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 
330 aa  360  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 
324 aa  360  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  54.4 
 
 
320 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 
329 aa  354  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  55.86 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 
324 aa  350  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  53.27 
 
 
331 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.32 
 
 
327 aa  349  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 
348 aa  348  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 
327 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 
331 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
329 aa  346  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 
327 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  52.62 
 
 
337 aa  345  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 
328 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 
328 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50.93 
 
 
333 aa  342  5e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  52.92 
 
 
328 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 
327 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 
324 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  52.66 
 
 
330 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
328 aa  331  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 
330 aa  329  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
321 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
329 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
330 aa  325  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
330 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
330 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
330 aa  325  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
330 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 
353 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
330 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
330 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
330 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
333 aa  323  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
329 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 
331 aa  323  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 
322 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 
327 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
328 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 
324 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
329 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
327 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 
334 aa  322  6e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  48.63 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  48.93 
 
 
330 aa  318  7.999999999999999e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  48.18 
 
 
331 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 
327 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 
332 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 
332 aa  316  3e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.87 
 
 
338 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 
330 aa  315  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 
326 aa  315  7e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
329 aa  315  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  45.76 
 
 
336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  51.52 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 
328 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  47.08 
 
 
336 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 
329 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 
329 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 
335 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  45.15 
 
 
336 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  45.96 
 
 
329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  45.51 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
327 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 
323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 
332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 
330 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
328 aa  305  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 
337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>