More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1657 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 322 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  69.38 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  61.64 
 
 		 330 aa  391  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  57.41 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  58.36 
 
 		 331 aa  358  7e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  59.12 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  56.04 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  57.41 
 
 		 350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  54.89 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  54.37 
 
 		 336 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  52.55 
 
 		 341 aa  352  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 330 aa  346  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  57.63 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  57.68 
 
 		 330 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  55.8 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  56.74 
 
 		 329 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  57.37 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  56.11 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 332 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.37 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.5 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 323 aa  330  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  52.81 
 
 		 332 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  57.05 
 
 		 329 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.14 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  56.11 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 324 aa  325  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 		 329 aa  325  9e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 328 aa  321  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 344 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  53.92 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  54.4 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  56.43 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  51.72 
 
 		 337 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.35 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  52.5 
 
 		 327 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  53.12 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  51.41 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 329 aa  309  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  54.23 
 
 		 342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 		 337 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 329 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  48.73 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.96 
 
 		 337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  49.05 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.54 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  52.72 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  51.57 
 
 		 326 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.43 
 
 		 332 aa  300  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  52.85 
 
 		 329 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  51.41 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  45 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  51.27 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 324 aa  298  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  50.79 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>