More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1293 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  92.56 
 
 		 336 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 336 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  84.83 
 
 		 337 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  79.23 
 
 		 337 aa  554  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  79.53 
 
 		 337 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  78.34 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  76.35 
 
 		 337 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  61.89 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  60.86 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  62.12 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  61.28 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  60.98 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  60.98 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  58.46 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  60.87 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  59.5 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  58.82 
 
 		 330 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  59.19 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  58.54 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  60.24 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  56.84 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  57.32 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  57.67 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  57.32 
 
 		 328 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  56.48 
 
 		 326 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  53.96 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  58.28 
 
 		 341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  55.73 
 
 		 329 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  54.46 
 
 		 329 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  53.05 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 		 332 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 353 aa  341  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  54.37 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  55.21 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.52 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  50.94 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.06 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.15 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.15 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  46.81 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  46.63 
 
 		 332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  48.02 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  45.77 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  44.82 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  48.11 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  45.12 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  44.82 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 		 332 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 337 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  43.89 
 
 		 331 aa  289  6e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  44.72 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  43.38 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  47.17 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  44.07 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 324 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>