More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0590 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  98.17 
 
 
328 aa  675    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  98.78 
 
 
328 aa  677    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
328 aa  684    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  82.93 
 
 
328 aa  589  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  60.3 
 
 
341 aa  434  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  60.79 
 
 
329 aa  432  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 
328 aa  422  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 
327 aa  411  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 
329 aa  358  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  52.29 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 
350 aa  348  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  50.76 
 
 
331 aa  341  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
338 aa  339  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
328 aa  335  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 
329 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 
327 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 
329 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 
330 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
331 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 
341 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 
330 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
330 aa  318  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  50.91 
 
 
335 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 
336 aa  315  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  315  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 
330 aa  315  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
330 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
330 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  48.01 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 
328 aa  309  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 
327 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 
328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
330 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
326 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  47.42 
 
 
337 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 
337 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  45.4 
 
 
327 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 
322 aa  299  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  46.5 
 
 
333 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 
337 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
323 aa  299  5e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 
336 aa  299  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.33 
 
 
337 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  46.46 
 
 
354 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  45.59 
 
 
337 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 
336 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 
325 aa  295  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
329 aa  295  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.01 
 
 
331 aa  295  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 
320 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 
344 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 
327 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.54 
 
 
332 aa  293  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  44.82 
 
 
337 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  42.99 
 
 
330 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  45.26 
 
 
344 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  47.09 
 
 
329 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.71 
 
 
333 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 
342 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
329 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 
330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 
326 aa  288  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  42.81 
 
 
334 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
337 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 
328 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 
331 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 
338 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 
330 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 
330 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  41.95 
 
 
330 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  43.73 
 
 
329 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  44.31 
 
 
329 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  41.77 
 
 
328 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  45.73 
 
 
350 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  43.87 
 
 
332 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  44.04 
 
 
331 aa  276  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 
329 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  42.04 
 
 
334 aa  275  9e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  42.94 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  44.31 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  42.33 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.33 
 
 
328 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 
333 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  43.25 
 
 
330 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 
330 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>