More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1618 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 350 aa  711    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  69.07 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  65.85 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  58.23 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  58.84 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  59.69 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  58.23 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  57.62 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  57.62 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  57.32 
 
 		 330 aa  359  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  57.85 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  56.83 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 342 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  55.35 
 
 		 329 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  55.79 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  57.32 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  55.79 
 
 		 330 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  58.39 
 
 		 326 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  54.88 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  55.21 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  55.56 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  55.93 
 
 		 331 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  54.1 
 
 		 337 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  54.8 
 
 		 337 aa  341  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 330 aa  340  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  57.27 
 
 		 329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  55.9 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 332 aa  338  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  53.19 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  57.45 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 329 aa  328  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 341 aa  322  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 329 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 329 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 		 341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 350 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 326 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  49.06 
 
 		 336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.68 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  44.82 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.29 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.08 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  50.45 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  46.01 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  43.71 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  47.96 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  53.12 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.68 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  44.68 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.98 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  45.12 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  44.2 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  42.95 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  45.14 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  43.26 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 331 aa  279  7e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 332 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  44.85 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  45.87 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.65 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.06 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  44.06 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  43.6 
 
 		 330 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  45.29 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>