More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3672 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 328 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  78.66 
 
 		 328 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  69.72 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  69.72 
 
 		 328 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  67.07 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  59.2 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  58.9 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  61.88 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  61.68 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  61.88 
 
 		 330 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  56.29 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  56.92 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  54.63 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 327 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.06 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  53.67 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  51.71 
 
 		 332 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  54.31 
 
 		 349 aa  321  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  53.77 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  53.04 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  54.14 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.57 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  52.09 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.48 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  52.55 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 328 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  51.27 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  54.43 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  52.06 
 
 		 331 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.37 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.95 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  52.55 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 324 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  49.37 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  50.95 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.42 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  48.89 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  48.1 
 
 		 337 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  48.57 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  49.21 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.64 
 
 		 320 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  48.73 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  48.09 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  48.24 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  49.04 
 
 		 350 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  48.41 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  46.96 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.94 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.94 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  48.41 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.17 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  46.82 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  48.1 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.82 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  48.41 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  48.41 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  50.64 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  47.77 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  48.09 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  48.09 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  48.09 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  48.09 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  45.69 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  51.28 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  48.78 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  48.09 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.73 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>