More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1866 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  79.2 
 
 		 329 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  69.02 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  70.37 
 
 		 330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  69.75 
 
 		 330 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  67.9 
 
 		 330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  66.36 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  66.05 
 
 		 330 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  66.36 
 
 		 327 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  65.42 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  64.49 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  64.8 
 
 		 326 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  62.23 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  60.37 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  60.49 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  59.13 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  58.51 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  58.2 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  59.13 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  58.82 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  60.19 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  58.82 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  56.07 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  56.97 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  57.36 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  58.84 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  56.7 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  56.13 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  58.95 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  57.28 
 
 		 350 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  57.32 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  56.7 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 332 aa  362  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 329 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  55.86 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  54.57 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  54.66 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  53.66 
 
 		 331 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  55.14 
 
 		 341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  55.03 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  55.08 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 		 330 aa  345  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  50.74 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  54.74 
 
 		 350 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 328 aa  328  8e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.48 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  48.17 
 
 		 328 aa  318  6e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.69 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  47.85 
 
 		 332 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.06 
 
 		 332 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 328 aa  299  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 332 aa  292  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.26 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.17 
 
 		 326 aa  288  8e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  45.45 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 334 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 329 aa  285  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  44.72 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 328 aa  281  7.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  45.79 
 
 		 334 aa  281  9e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>