More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0339 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 331 aa  682    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  72.73 
 
 		 334 aa  511  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  72.73 
 
 		 330 aa  509  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  70.48 
 
 		 333 aa  502  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  70.69 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  64.95 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  63.94 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  63.94 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  61.59 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  61.28 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  60.74 
 
 		 328 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  59.45 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  59.94 
 
 		 326 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  60.31 
 
 		 328 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  54.85 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  56.84 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  59.02 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  55.05 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  57.28 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  55.05 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  55.05 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 332 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  56.25 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.66 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  54.04 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 337 aa  361  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 330 aa  361  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  53.58 
 
 		 332 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  54.37 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 323 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50.92 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  53.17 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.02 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.79 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.35 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  52.19 
 
 		 321 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 		 351 aa  326  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 326 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 326 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.08 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.87 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  47.48 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 327 aa  315  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  47.11 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 323 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  48.59 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.84 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  48.91 
 
 		 335 aa  308  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.91 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  46.56 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>