More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1369 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 333 aa  689    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  84.59 
 
 		 331 aa  608  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  70.48 
 
 		 331 aa  502  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  68.47 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  67.27 
 
 		 330 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  62.95 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  61.14 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  61.14 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  63.3 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  63.22 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  61.21 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 		 328 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  59.09 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  58.66 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  57.83 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  61.09 
 
 		 329 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  56.53 
 
 		 330 aa  374  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  57.27 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  56.53 
 
 		 330 aa  374  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  56.53 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  56.84 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.31 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 		 328 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  52.57 
 
 		 327 aa  359  5e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 		 330 aa  358  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  53.07 
 
 		 328 aa  351  8.999999999999999e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 332 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 337 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  53.25 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.63 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  52.58 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  51.65 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  52.81 
 
 		 331 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.96 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 326 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 329 aa  319  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  51.35 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 328 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  47.73 
 
 		 327 aa  312  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  50.93 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.34 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  48.17 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.96 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 329 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.57 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  45.65 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.73 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>