More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0159 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  98.48 
 
 		 330 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  87.27 
 
 		 330 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  62.73 
 
 		 328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  62.73 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  62.62 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  62.35 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  61.73 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  61.88 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  61.2 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  60.25 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  54.72 
 
 		 324 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  53.16 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.69 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  53.75 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  53.44 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  55.38 
 
 		 331 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  52.19 
 
 		 332 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  55.28 
 
 		 330 aa  332  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  54.69 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  53.94 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.06 
 
 		 332 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 		 327 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  53.31 
 
 		 324 aa  325  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 		 330 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 329 aa  318  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  52.22 
 
 		 349 aa  318  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  49.21 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  51.9 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  48.14 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  49.37 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  45.89 
 
 		 321 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.52 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  49.68 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  47.84 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.78 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.11 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.27 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  47.48 
 
 		 336 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  46.52 
 
 		 329 aa  291  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  43.67 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.86 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  44.79 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  46.58 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  46.75 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.13 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>