More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1402 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
332 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  64.95 
 
 
331 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  62.24 
 
 
331 aa  435  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  62.12 
 
 
330 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  61.45 
 
 
334 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  62.95 
 
 
333 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 
330 aa  418  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 
330 aa  418  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  54.13 
 
 
327 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  56.1 
 
 
328 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  56.1 
 
 
328 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  55.38 
 
 
328 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 
328 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 
328 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  53.82 
 
 
326 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  54.27 
 
 
354 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 
329 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  52.28 
 
 
330 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 
330 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 
330 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
330 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
330 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
330 aa  355  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
330 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
330 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 
330 aa  349  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 
329 aa  349  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.23 
 
 
332 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
330 aa  345  7e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 
332 aa  342  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.01 
 
 
332 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 
324 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 
327 aa  330  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.39 
 
 
333 aa  329  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
331 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 
330 aa  328  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 
326 aa  328  7e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.79 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 
328 aa  322  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 
329 aa  322  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 
324 aa  320  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  49.55 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
329 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
332 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  50.61 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  48.17 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 
320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 
337 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  49.21 
 
 
328 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 
329 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 
328 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 
323 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 
337 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 
328 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  43.21 
 
 
351 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 
321 aa  299  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
324 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  45.59 
 
 
328 aa  298  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 
323 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  43.77 
 
 
327 aa  296  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 
332 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  46.3 
 
 
324 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 
334 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.26 
 
 
327 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 
322 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 
328 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  48.25 
 
 
328 aa  292  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 
328 aa  292  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 
321 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 
328 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 
328 aa  291  7e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
330 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 
328 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 
328 aa  291  9e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 
356 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 
337 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  47.19 
 
 
337 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 
326 aa  290  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 
327 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 
327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.74 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 
321 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 
329 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 
330 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.75 
 
 
330 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 
328 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  45.32 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 
329 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 
318 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 
327 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>