More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5380 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
330 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  99.39 
 
 
330 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  98.79 
 
 
330 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  99.09 
 
 
330 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  99.39 
 
 
330 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  98.79 
 
 
330 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  99.7 
 
 
330 aa  687    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  96.36 
 
 
330 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  64.31 
 
 
328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  64.62 
 
 
328 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  61.89 
 
 
328 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  61.89 
 
 
328 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  59.33 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  58.1 
 
 
327 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 
330 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 
330 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  55.83 
 
 
326 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  56.71 
 
 
334 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  55.05 
 
 
331 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  55.96 
 
 
330 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 
328 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 
333 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  58.02 
 
 
324 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 
331 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 
328 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 
330 aa  359  3e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  51.84 
 
 
330 aa  359  3e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  52.6 
 
 
332 aa  358  6e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  54.01 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
337 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  55.76 
 
 
328 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
337 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  53.09 
 
 
332 aa  350  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 
329 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
328 aa  348  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 
329 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  51.54 
 
 
332 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
323 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  52.47 
 
 
324 aa  333  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
329 aa  332  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 
328 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
328 aa  329  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  51.39 
 
 
327 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 
327 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
331 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
328 aa  328  7e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.4 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
332 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
332 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 
324 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 
316 aa  322  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 
332 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  49.23 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 
329 aa  318  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 
351 aa  318  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 
334 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 
327 aa  317  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 
326 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 
318 aa  315  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
326 aa  315  9e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.77 
 
 
327 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 
320 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 
334 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
328 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.43 
 
 
333 aa  309  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  48.93 
 
 
331 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  51.71 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 
326 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 
332 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
321 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 
330 aa  305  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
327 aa  305  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  48.91 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
319 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 
338 aa  299  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 
330 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 
329 aa  296  4e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  47.04 
 
 
333 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 
327 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 
324 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  47.84 
 
 
337 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 
326 aa  293  3e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
329 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 
323 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
329 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 
353 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 
330 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
332 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 
329 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
320 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  45.99 
 
 
337 aa  288  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>