More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4827 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 329 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  73.85 
 
 		 332 aa  511  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  73.23 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  73.15 
 
 		 332 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  69.23 
 
 		 332 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  68.92 
 
 		 332 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  68.31 
 
 		 333 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  69.02 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  69.44 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  68.1 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  61.3 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  56.92 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  56.35 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  57.59 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  54.52 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  58.88 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  57.68 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  58.02 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  56.39 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  59.43 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  55.45 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  53.87 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.97 
 
 		 328 aa  364  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  55.73 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 329 aa  358  7e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  56.35 
 
 		 329 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  58.62 
 
 		 321 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 348 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 330 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  54.8 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  58.62 
 
 		 321 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  52.16 
 
 		 327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  52.17 
 
 		 326 aa  350  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  58.13 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  54.01 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  54.15 
 
 		 337 aa  348  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  53.7 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  54.94 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  53.12 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  52.34 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  50.77 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  54.32 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.15 
 
 		 329 aa  338  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  51.4 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  50.15 
 
 		 330 aa  335  9e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  52.85 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  51.82 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  52.01 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  51.69 
 
 		 328 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  53.61 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 330 aa  329  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 330 aa  329  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  51.58 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  49.08 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 328 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  50.47 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.77 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 349 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  48.6 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  46.95 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>