More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4002 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 327 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  93.58 
 
 		 327 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  62.42 
 
 		 328 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  62.42 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  60.74 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  60.87 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  59.2 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  62.35 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  62.65 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  57.05 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  54.57 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  52.72 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 329 aa  341  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  54.11 
 
 		 327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  53.04 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.22 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 332 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.72 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 		 332 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  49.36 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.53 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  51.44 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  51.12 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.47 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  53.04 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  50.8 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 328 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  52.72 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 326 aa  308  9e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  50.32 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.42 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  47.6 
 
 		 354 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  46.04 
 
 		 348 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  49.68 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  46.96 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  48.89 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.28 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.3 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  48.56 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 328 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  47.6 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  48.73 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  47.28 
 
 		 324 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.6 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  44.9 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  48.57 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  45.08 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  43.63 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  44.76 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50.74 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.08 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  51.11 
 
 		 322 aa  281  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.5 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  46.18 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.86 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  44.9 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 338 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  44.09 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  47.96 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>