More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2084 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 328 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  89.33 
 
 		 328 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  64.31 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  64.11 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  64.31 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  65.44 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  63.5 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  63.8 
 
 		 330 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  63.8 
 
 		 330 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  63.5 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  63.19 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  63.19 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  62.88 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  60.74 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  63.69 
 
 		 354 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  66.26 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  61.66 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  59.33 
 
 		 327 aa  411  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  61.16 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  60.31 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  60.82 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  59.02 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  56.44 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  59.08 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  61.3 
 
 		 324 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  54.77 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  55.21 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  57.28 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  53.37 
 
 		 327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  55.38 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 328 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 329 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  54.18 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  53.23 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 337 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  54.8 
 
 		 332 aa  355  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 337 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 328 aa  355  7.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  54.97 
 
 		 331 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.94 
 
 		 333 aa  350  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  51.83 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  53.99 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  53.61 
 
 		 327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  55.24 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 		 329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  55.31 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  54.72 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 327 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 323 aa  332  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  55.94 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 		 326 aa  329  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 351 aa  325  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 320 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 334 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 332 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 		 332 aa  321  9.000000000000001e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  50.15 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  51.45 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 		 321 aa  318  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 332 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  47.76 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 337 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 324 aa  310  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  48.2 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  50.94 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.94 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  46.59 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  48.79 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  48.44 
 
 		 327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  46.75 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  47.4 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  46.45 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  46.45 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>