More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1662 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
330 aa  684    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  63.61 
 
 
328 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  63.3 
 
 
328 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  60.91 
 
 
354 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 
327 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  58.84 
 
 
328 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  61.47 
 
 
329 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  57.75 
 
 
330 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  56.44 
 
 
328 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 
330 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.44 
 
 
328 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 
330 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 
330 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 
330 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 
330 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 
328 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 
330 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 
330 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 
330 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  52.42 
 
 
331 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  53.33 
 
 
330 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 
328 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  55.28 
 
 
333 aa  371  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  53.31 
 
 
333 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
331 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 
329 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  52.12 
 
 
334 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  53.42 
 
 
332 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  56.31 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 
332 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 
332 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  51.66 
 
 
328 aa  358  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  54.97 
 
 
321 aa  358  9e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  51.68 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  54.27 
 
 
326 aa  354  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 
329 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
332 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 
330 aa  352  4e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 
330 aa  352  4e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
337 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
337 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
327 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 
328 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 
332 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  49.39 
 
 
332 aa  345  7e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
329 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
330 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
328 aa  342  5.999999999999999e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
323 aa  341  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
326 aa  340  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  52 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 
325 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 
332 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 
327 aa  328  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
329 aa  328  8e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  48.34 
 
 
331 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 
331 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
324 aa  323  4e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 
321 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 
327 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
321 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  45.59 
 
 
327 aa  315  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.73 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 
327 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  47.55 
 
 
328 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 
334 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 
327 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 
318 aa  305  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 
316 aa  305  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.62 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  45.27 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
328 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  47.62 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
319 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  43.56 
 
 
332 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 
326 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 
327 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 
338 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 
344 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 
328 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 
326 aa  299  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 
330 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 
332 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  46.24 
 
 
356 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 
344 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  43.73 
 
 
327 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>