More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2242 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 326 aa  679    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  63.22 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  59.94 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  60.49 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  59.33 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  58.1 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  59.08 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  56.13 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  58.15 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  55.08 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  53.82 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  52.76 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  54.15 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 		 328 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  54.13 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  51.68 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  54.13 
 
 		 328 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.21 
 
 		 354 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 		 328 aa  345  7e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  52.13 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  52 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 329 aa  342  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  52.78 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 321 aa  335  7e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 332 aa  332  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 331 aa  332  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.96 
 
 		 328 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 323 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  48.14 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  50.78 
 
 		 337 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 332 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 332 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 		 327 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.83 
 
 		 332 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  45.34 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 320 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  48.49 
 
 		 331 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 327 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 332 aa  301  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  44.86 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  48.14 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 332 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.65 
 
 		 330 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  45.03 
 
 		 333 aa  296  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  45.94 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 326 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 322 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  45.17 
 
 		 329 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  46.5 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  45.91 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  43.96 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  44.79 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 316 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  45.94 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 		 353 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 330 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  45.64 
 
 		 356 aa  288  9e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  43.3 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>