More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4409 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 316 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  67.63 
 
 		 318 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  65.4 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  67.31 
 
 		 319 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  69.3 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  64.17 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  62.97 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  62.86 
 
 		 320 aa  384  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  64.22 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  61.71 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  61.66 
 
 		 322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  60.5 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  62.7 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  62.38 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.31 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  58.36 
 
 		 321 aa  332  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 		 328 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  322  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  322  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 330 aa  322  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  56.47 
 
 		 329 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.16 
 
 		 354 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  53.63 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  308  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  50.95 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.42 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.61 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 328 aa  295  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  47.17 
 
 		 330 aa  291  7e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 332 aa  291  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  48.3 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  49.68 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  50.32 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  46.27 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.06 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  48.12 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  45.11 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.06 
 
 		 332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  43.85 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  46.25 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 356 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  45.51 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  48.73 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.04 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.17 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>