More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4862 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 322 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  76.71 
 
 		 320 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  61.76 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  61.66 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  57.51 
 
 		 319 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  58.23 
 
 		 327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  55.7 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  56.33 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  55 
 
 		 318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  56.43 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  59.37 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  48.57 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  44.55 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 329 aa  261  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  47.53 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  44.58 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  45.83 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  44.44 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.2 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  43.16 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  45.4 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.61 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  43.16 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  44.41 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.35 
 
 		 330 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.35 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  41.8 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  40.74 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  41.3 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  46.38 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  45.78 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  42.68 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  47.81 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  42.2 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  45.06 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 		 327 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  40.8 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  44.04 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  44.98 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  43.08 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  45.72 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  42.99 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  41.43 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  41.23 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  46.38 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  43.38 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.39 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  43.56 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  44.38 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  43.87 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  45.83 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  46.51 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  37.89 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  46.51 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  43.34 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>