More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4903 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 320 aa  620  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  65.52 
 
 		 319 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  63.32 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  62.97 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  64.22 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  61.13 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  62.58 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  59.74 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  59.69 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  58.31 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  58.49 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  59.25 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  48.6 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 323 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.56 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  47.04 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.57 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  46.42 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  46.56 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  47.81 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  45.94 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  42.95 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 328 aa  261  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  44.97 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 		 328 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  42.45 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  49.52 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  42.15 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 332 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.62 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  48.72 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.26 
 
 		 332 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  47.56 
 
 		 329 aa  254  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  46.22 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  51.5 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  44.86 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  42.63 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  50.93 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  48.33 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 		 329 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  51.16 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.11 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  43.96 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  49.2 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>