More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1830 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 327 aa  656    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  69.4 
 
 		 320 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  69.78 
 
 		 321 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  64.54 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  62.97 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  63.72 
 
 		 321 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  61.51 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  58.75 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  60.19 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  57.28 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  58.23 
 
 		 322 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  58.49 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  58.18 
 
 		 327 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  57.99 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  51.74 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.34 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.63 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  305  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 329 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.56 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 337 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 323 aa  295  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  49.68 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 328 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  49.2 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  47.65 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  44.03 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.27 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.32 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  46.89 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.91 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 351 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 332 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  46.56 
 
 		 337 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  44.86 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  45.45 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  44.85 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  41.37 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  42.06 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  44.17 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>