More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1771 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
328 aa  675    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  64.94 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  65.34 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  63.91 
 
 
328 aa  434  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  60.98 
 
 
327 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  58.54 
 
 
327 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 
328 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  53.21 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  51.82 
 
 
328 aa  352  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  51.82 
 
 
328 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  349  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.74 
 
 
331 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  348  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  348  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  54.46 
 
 
328 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 
330 aa  348  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 
351 aa  347  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
328 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
330 aa  342  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
334 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  51.37 
 
 
330 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 
329 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  48.48 
 
 
334 aa  323  3e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 
329 aa  320  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 
324 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 
327 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 
330 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  47.42 
 
 
330 aa  315  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.33 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  47.11 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 
333 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.33 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.09 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  47.68 
 
 
332 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
332 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  45.59 
 
 
332 aa  298  8e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 
319 aa  298  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.65 
 
 
326 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 
332 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 
332 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 
321 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 
321 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 
328 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 
329 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 
318 aa  291  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 
331 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
334 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
332 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 
332 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 
323 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 
337 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 
337 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.32 
 
 
333 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  46.3 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.68 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.68 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 
324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  46.13 
 
 
327 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  46.91 
 
 
329 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 
328 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 
330 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  42.68 
 
 
328 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 
321 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  47.24 
 
 
327 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 
325 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 
328 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.48 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  44.14 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  42.2 
 
 
326 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  44.75 
 
 
327 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  43.96 
 
 
328 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  44.75 
 
 
325 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 
329 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  42.07 
 
 
327 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 
327 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 
320 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  42.41 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  43.44 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 
356 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  41.8 
 
 
350 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  43.17 
 
 
331 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  43.34 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>