More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2290 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 325 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  78.77 
 
 		 325 aa  541  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  80.06 
 
 		 328 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  77.26 
 
 		 327 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  76.01 
 
 		 330 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  73.21 
 
 		 321 aa  504  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  70.35 
 
 		 329 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  44.75 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  44.72 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  44.75 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 330 aa  281  7.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 		 328 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  42.15 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  43.44 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  46.73 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  43.87 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  42.72 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.21 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  42.45 
 
 		 333 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  44.75 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  43.57 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  42.28 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 332 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  41.98 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  42.95 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  42.99 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  41.49 
 
 		 332 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  40.56 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  43.71 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  41.12 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  39.81 
 
 		 330 aa  257  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  39.81 
 
 		 330 aa  257  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  39.63 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  43.25 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  43.17 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  42.45 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  41.12 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  39.32 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 330 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  41.12 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  42.37 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  40.88 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  41.12 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  42.28 
 
 		 333 aa  251  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  41.49 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.27 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  41.3 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  40.62 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  42.2 
 
 		 323 aa  248  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  41.09 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  41.49 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  43.04 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  41.85 
 
 		 326 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  39.69 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  43.6 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 		 330 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  40.99 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  42.02 
 
 		 332 aa  242  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  42.38 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  40.49 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  41.12 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  40.81 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  42.27 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  42.33 
 
 		 335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  41.82 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  40.43 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>