More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0107 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 343 aa  712    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  87.94 
 
 		 366 aa  626  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  71.06 
 
 		 351 aa  518  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  62.61 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 		 339 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  61.9 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  61.9 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  61.61 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  62.02 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  61.01 
 
 		 337 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  61.01 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  61.13 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  60.18 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 340 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 340 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  58.04 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  58.04 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  59.29 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  59.29 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  59.64 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  58.46 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  59.59 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  58.04 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  57.74 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  61.31 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  57.52 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  56.64 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  56.34 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  56.56 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  57.82 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  56.64 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  56.34 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  58.75 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  57.69 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  56.34 
 
 		 338 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  57.27 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  56.97 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  59.64 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  57.88 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  57.57 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  58.18 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  59 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  58.04 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  56.51 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  58.93 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  59.23 
 
 		 337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  58.61 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  58.7 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  58.11 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  58.11 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  57.74 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  58.46 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  57.27 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  57.52 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  58.05 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  57.74 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  56.76 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  58.82 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  58.11 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  57.52 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  57.02 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 337 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  57.58 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  53.24 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  56.8 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  56.55 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  57.1 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  57.44 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  56.08 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  55.13 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  55.13 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  56.01 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  56.08 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  55.23 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  56.38 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  56.55 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  56.38 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  57.1 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  56.38 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>