More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 355 aa  737    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  66.38 
 
 		 351 aa  491  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3079  UDP-glucose 4-epimerase  65.31 
 
 		 380 aa  482  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  61.14 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  58.69 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  59.03 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  59.6 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  57.35 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  55.87 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  55.87 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  57.35 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  59.26 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  57.34 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  60.62 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  56.73 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  57.51 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  55.59 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  56.77 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  56.16 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  58.12 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  59.65 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  56.86 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  55.46 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  57.51 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  56.86 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  59.49 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  59.49 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  59.49 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  59.21 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  58.07 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  56.86 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  57.79 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  54.44 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  57.26 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  56.86 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  56.94 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  55.33 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  54.31 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  54.31 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  54.31 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  54.31 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  56.94 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  54.31 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  56.57 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.27 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  57.47 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  55.4 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  57.18 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  56.46 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  56 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  56.16 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  57.02 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  56.45 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  56.2 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  54.44 
 
 		 338 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  53.01 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  54.15 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  54.15 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  54.15 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  54.44 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  58.07 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  56.2 
 
 		 337 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  53.87 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  57.76 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  54.44 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  54.02 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  53.24 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  55.84 
 
 		 339 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  56.2 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  54.76 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  53.87 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  56.03 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  53.01 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  55.04 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  52.44 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  52.72 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  52.72 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  52.72 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  52.44 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  53.31 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>