More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0346 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 351 aa  728    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  66.38 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3079  UDP-glucose 4-epimerase  64.36 
 
 		 380 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  60.47 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  60.77 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  61.65 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  61.65 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  61.76 
 
 		 339 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  60.77 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  59.29 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  61.36 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  59.12 
 
 		 337 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  60.47 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  60.59 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  60.65 
 
 		 337 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  59.59 
 
 		 338 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  59.41 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  59.17 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  58.53 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  58.82 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  58.6 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  59.12 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  59.12 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  58.53 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  58.53 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  59.18 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  58.24 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  58.53 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  58.53 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  58.24 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  57.69 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  58.24 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  58.24 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  58.24 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  57.73 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  57.73 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  57.4 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  56.21 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  56.51 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  57.35 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  58.28 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  56.51 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  57.99 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  59.29 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  56.51 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  56.56 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  60.64 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  55.92 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  56.56 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  56.56 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  55.92 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  56.8 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  59.48 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  59.77 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1768  UDP-glucose 4-epimerase  59.41 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.485025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  57.23 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  53.56 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  55.75 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  55.16 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  57.1 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  55.88 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  56.05 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  56.51 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  56.21 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  54.12 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  54.14 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  56.64 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  56.98 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  55.59 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  53.82 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  54.87 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  54.44 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  54.73 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  53.25 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  55.33 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  56.76 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  55.46 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  56.93 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  54.73 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  54.73 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  54.73 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>