More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3965 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  91.69 
 
 
338 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  90.8 
 
 
337 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  90.8 
 
 
338 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  91.1 
 
 
338 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
339 aa  699    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  90.21 
 
 
342 aa  638    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  91.69 
 
 
338 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  89.58 
 
 
336 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  91.69 
 
 
338 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  88.96 
 
 
338 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  83.63 
 
 
338 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  83.04 
 
 
338 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  83.04 
 
 
338 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  82.74 
 
 
338 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  82.74 
 
 
338 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  74.33 
 
 
337 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  73.29 
 
 
337 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  72.24 
 
 
337 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  69.14 
 
 
337 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  67.16 
 
 
337 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  67.26 
 
 
336 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  64.6 
 
 
339 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  66.47 
 
 
337 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  65.77 
 
 
337 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  65.48 
 
 
337 aa  474  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  65.48 
 
 
337 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  65.18 
 
 
337 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  65.18 
 
 
337 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  65.48 
 
 
337 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  65.07 
 
 
337 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  64.78 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  65.07 
 
 
337 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  65.07 
 
 
337 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  63.61 
 
 
339 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  63.69 
 
 
337 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  63.58 
 
 
341 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  63.2 
 
 
340 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  63.06 
 
 
337 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  62.43 
 
 
351 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  64.5 
 
 
341 aa  457  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  64.88 
 
 
339 aa  457  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  63.06 
 
 
340 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  63.06 
 
 
340 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  62.46 
 
 
340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  62.2 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 
336 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  63.66 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  65.47 
 
 
340 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  65.17 
 
 
340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  62.46 
 
 
340 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  65.47 
 
 
340 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  61.42 
 
 
339 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  62.46 
 
 
340 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  62.76 
 
 
340 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  65.47 
 
 
340 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  62.76 
 
 
340 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  63.8 
 
 
338 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  62.46 
 
 
340 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  62.76 
 
 
340 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  65.17 
 
 
340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  65.17 
 
 
340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  64.86 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  61.79 
 
 
336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  59.64 
 
 
342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  62.46 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  65.17 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  61.24 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  60.24 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  61.13 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  59.7 
 
 
337 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  62.09 
 
 
337 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  59.64 
 
 
338 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 
338 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3079  UDP-glucose 4-epimerase  59.5 
 
 
380 aa  438  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  61.79 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  63.06 
 
 
340 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  60.6 
 
 
335 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  60.49 
 
 
335 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 
339 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  61.95 
 
 
341 aa  434  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  57.66 
 
 
352 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  59.28 
 
 
341 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  57.31 
 
 
337 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  60.23 
 
 
353 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  59 
 
 
339 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  60.88 
 
 
340 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  61.76 
 
 
351 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  58.58 
 
 
338 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  58.38 
 
 
341 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  60.36 
 
 
339 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  61.98 
 
 
336 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  59.35 
 
 
337 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 
335 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  60.06 
 
 
336 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  58.38 
 
 
341 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  58.63 
 
 
343 aa  421  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  60.48 
 
 
334 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1768  UDP-glucose 4-epimerase  61.54 
 
 
340 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.485025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>