More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2609 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  94.66 
 
 		 337 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  97.63 
 
 		 337 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  91.99 
 
 		 337 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  93.18 
 
 		 337 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  92.58 
 
 		 337 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  92.28 
 
 		 337 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 337 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  99.11 
 
 		 337 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  99.11 
 
 		 337 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  86.31 
 
 		 337 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  87.76 
 
 		 337 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  85.37 
 
 		 338 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  85.97 
 
 		 341 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  82.74 
 
 		 339 aa  597  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  83.93 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  80.06 
 
 		 338 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  75.6 
 
 		 336 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  68.84 
 
 		 337 aa  488  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  67.16 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  70.54 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  69.85 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  66.27 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  65.18 
 
 		 336 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  66.27 
 
 		 338 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 		 339 aa  478  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 		 337 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  65.37 
 
 		 338 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  65.07 
 
 		 338 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  66.87 
 
 		 337 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  65.37 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  64.78 
 
 		 338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  64.97 
 
 		 337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  64.58 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  65.37 
 
 		 337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 		 338 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 		 338 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  62.8 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  62.8 
 
 		 338 aa  461  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  62.8 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  63.28 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  67.06 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  63.28 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  63.91 
 
 		 342 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  63.28 
 
 		 336 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  64.74 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  63.72 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  65.44 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 		 336 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 		 339 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  61.19 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  65.48 
 
 		 335 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  64.07 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  63.99 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  63.37 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  64.26 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  64.37 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  64.6 
 
 		 341 aa  447  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  63.39 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  62.57 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  64.07 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  63.77 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  63.77 
 
 		 340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  62.87 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  64.29 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  62.87 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  63.77 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  63.47 
 
 		 340 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  60.71 
 
 		 337 aa  441  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  61.9 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  60.3 
 
 		 339 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  64.48 
 
 		 337 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 338 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  62.39 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  63.53 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  62.69 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  61.68 
 
 		 337 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  62.5 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  61.61 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  62.5 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  60.24 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  62.5 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  61.9 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  62.08 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  62.2 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  61.49 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  59.94 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  61.68 
 
 		 339 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>