More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2883 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
338 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  96.15 
 
 
338 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  95.86 
 
 
338 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  95.56 
 
 
338 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  100 
 
 
338 aa  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  99.41 
 
 
338 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  99.7 
 
 
338 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  95.56 
 
 
338 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  100 
 
 
338 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  99.7 
 
 
338 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  93.49 
 
 
338 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  99.41 
 
 
338 aa  701    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  95.86 
 
 
338 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  76.92 
 
 
338 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  76.92 
 
 
339 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  76.63 
 
 
338 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  76.33 
 
 
339 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  76.04 
 
 
338 aa  541  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  76.33 
 
 
338 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  76.33 
 
 
338 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  65.98 
 
 
338 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  65.68 
 
 
338 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 
339 aa  474  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  64.79 
 
 
338 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  65.48 
 
 
339 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  64.29 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  62.69 
 
 
338 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  60.71 
 
 
342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 
337 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  62.8 
 
 
337 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 
337 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 
337 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  62.2 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 
337 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 
338 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  62.2 
 
 
337 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  61.9 
 
 
337 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  61.61 
 
 
335 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  61.9 
 
 
337 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  57.86 
 
 
373 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 
337 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 
341 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 
338 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 
337 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  59.23 
 
 
338 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  61.59 
 
 
335 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  58.98 
 
 
338 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  58.51 
 
 
340 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 
339 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  56.6 
 
 
342 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  56.6 
 
 
342 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  55.86 
 
 
352 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 
341 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 
339 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  56.51 
 
 
337 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  56.42 
 
 
337 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  56.85 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  56.25 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  55.95 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  56.25 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  57.45 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 
338 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 
338 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 
351 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 
337 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  56.25 
 
 
338 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  55.39 
 
 
349 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  55.65 
 
 
336 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  55.06 
 
 
338 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  54.73 
 
 
339 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 
340 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  56.55 
 
 
337 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 
345 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  52.44 
 
 
355 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  57.32 
 
 
338 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 
338 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  56.85 
 
 
335 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 
340 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  54.73 
 
 
342 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.33 
 
 
337 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  54.44 
 
 
339 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  56.85 
 
 
335 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  54.2 
 
 
353 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 
340 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  56.21 
 
 
339 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  54.52 
 
 
334 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2530  UDP-glucose 4-epimerase  56.85 
 
 
337 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000741336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  55.99 
 
 
340 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 
340 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  54.76 
 
 
339 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 
340 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  55.65 
 
 
337 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 
340 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  55.06 
 
 
338 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  56.29 
 
 
339 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  54.35 
 
 
351 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>