More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2224 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 336 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  83.93 
 
 		 337 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  83.93 
 
 		 337 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  83.93 
 
 		 337 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  83.63 
 
 		 337 aa  591  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  83.33 
 
 		 337 aa  591  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  81.85 
 
 		 337 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  80.95 
 
 		 337 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  81.25 
 
 		 337 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  80.36 
 
 		 339 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  80.95 
 
 		 337 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  80.65 
 
 		 337 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  79.7 
 
 		 337 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  79.17 
 
 		 341 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  78.51 
 
 		 338 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  76.79 
 
 		 338 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  71.43 
 
 		 336 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  67.26 
 
 		 339 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  66.57 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  65.97 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  66.27 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  69.55 
 
 		 340 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  66.07 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  68.66 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  65.18 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  65.67 
 
 		 338 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  66.27 
 
 		 338 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  66.57 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  65.48 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  68.75 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  64.48 
 
 		 338 aa  471  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  65.28 
 
 		 337 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  65.37 
 
 		 338 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  66.27 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  65.67 
 
 		 337 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  61.9 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 		 338 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  64.56 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  61.9 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 		 338 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  64.2 
 
 		 339 aa  457  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  63.28 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  64.26 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  64.55 
 
 		 339 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  64.29 
 
 		 339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  63.8 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  65.17 
 
 		 339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  66.26 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  63.99 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  61.79 
 
 		 336 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  63.88 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  64.09 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  63.29 
 
 		 351 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  63.36 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  65.97 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  63.47 
 
 		 339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  63.06 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  64.63 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  64.22 
 
 		 335 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  64.37 
 
 		 340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  62.83 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  61.86 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  62.79 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  62.87 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  63.1 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  63.77 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  63.17 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  62.69 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  62.87 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  62.69 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  63.17 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  63.69 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  63.17 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  61.79 
 
 		 341 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  62.57 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  62.2 
 
 		 373 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  62.87 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  61.31 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  61.13 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  61.79 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  61.68 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  63.17 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  61.61 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  61.61 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  63.88 
 
 		 335 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  58.81 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  61.49 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  61.61 
 
 		 339 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  61.38 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  62.69 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  62.5 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 345 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  61.01 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>