More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1914 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 335 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  74.1 
 
 		 339 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  72.89 
 
 		 338 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  71.69 
 
 		 336 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  71.21 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  70.43 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  65.86 
 
 		 334 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  63.53 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  66.97 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  63.83 
 
 		 338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  65.65 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  64.22 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  65.64 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  66.57 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  65.44 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  65.55 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  63.03 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  65.55 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  64.22 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  66.67 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  66.77 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  66.06 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  66.06 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  64.13 
 
 		 335 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  66.77 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  62.92 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  63.53 
 
 		 337 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  66.77 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  63.91 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  63.83 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  66.46 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  66.46 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  65.75 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  66.46 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  66.16 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  63.83 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  66.46 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  65.05 
 
 		 338 aa  437  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  63.53 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  63.53 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  63.61 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  63.61 
 
 		 337 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  62.61 
 
 		 334 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  60.49 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  63 
 
 		 337 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  64.22 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  62.92 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  63.03 
 
 		 339 aa  431  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  64.53 
 
 		 340 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  65.86 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  63.72 
 
 		 337 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  62.39 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  65.64 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  59.33 
 
 		 336 aa  427  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  60.36 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  62.73 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  59.27 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  62.61 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  63.61 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  60.61 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  60.91 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  60.55 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  59.02 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  60.79 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  59.51 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  61.28 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  60.91 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  59.39 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  61.59 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  55.93 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  58.84 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  60.73 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  61.28 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  60.06 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  61.28 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  60.06 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  60.67 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  61.28 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>