More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0776 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 345 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  65.37 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  61.38 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  62.28 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  64.83 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  64.63 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  65.64 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  60.36 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  60.9 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  63.64 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  58.98 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  61.77 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  60 
 
 		 338 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  61.08 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  60.71 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  59.47 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  61.08 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  60.78 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  59.28 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  58.68 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  60.66 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  55.92 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  57.91 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  57.91 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  58.51 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 338 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  58.81 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  57.91 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  59.16 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  57.56 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  60.6 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  58.21 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  56.97 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  57.1 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  58.04 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  58.28 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  58.04 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  58.04 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  57.4 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  58.08 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  57.66 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  58.98 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  59.28 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  55.92 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  58.41 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  56.68 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  57.19 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  55.33 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  58.08 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  58.08 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  54.33 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  56.59 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  57.78 
 
 		 338 aa  394  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  58.08 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  58.08 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  54.13 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  55.79 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  57.78 
 
 		 338 aa  394  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  57.78 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  58.08 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  57.78 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  57.78 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  54.17 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>