More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2591 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 337 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  74.63 
 
 		 337 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  68.66 
 
 		 336 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  59.82 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 337 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  59.64 
 
 		 337 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  59.35 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  59.35 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  59.64 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  59.64 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  58.75 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  58.81 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  62.2 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  61.38 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  59.35 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 340 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 340 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  61.79 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  56.12 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  58.21 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  61.98 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  60.78 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  60.78 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  54.93 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  54.93 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  58.21 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  54.93 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  54.93 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  58.98 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  57.91 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  55.22 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  57.91 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  60 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  60.66 
 
 		 340 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  56.42 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  59.1 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  59.1 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  56.12 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 340 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  56.76 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  58.26 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  56.55 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  56.68 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  57.61 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  61.79 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  56.59 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  54.93 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  59.7 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  56.08 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  58.41 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  58.38 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  54.03 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1768  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.485025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  55.19 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  54.76 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  56.16 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  55.22 
 
 		 337 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>