More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2821 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 332 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.02 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.02 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  43.69 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  43.56 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  42.11 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  41.85 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  44.07 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  44.41 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  40.8 
 
 		 331 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  41.07 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  42.94 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  39.75 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  39.88 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  42.27 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  38.75 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  45.77 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  47.34 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  41.85 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  38.56 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  46.08 
 
 		 329 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  42.73 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  43.87 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  41.43 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 322 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  43.3 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  44.41 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  42.39 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  45.87 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  41.28 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  44.28 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  44.07 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  41.62 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  40.54 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  38.75 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  43.24 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  41.02 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  42.25 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  41.02 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  44.1 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  41.32 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  42.02 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.45 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  41.02 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  41.3 
 
 		 332 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  42.04 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  42.11 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  43.22 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  40.72 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  42.64 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  39.01 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  42.95 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  41.27 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  40.67 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  39.7 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  38.74 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  42.33 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  39.14 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  38.94 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  39.4 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  41.93 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  41.92 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  40.48 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  41.07 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  40.96 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  39.22 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  38.94 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  39.38 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>